Les cellules T préexistantes spécifiques de la polymérase se développent dans les cas de SRAS-CoV-2 séronégatifs abortifs.

Résumé

Les personnes potentiellement exposées au SRAS-CoV-2 ne développent pas nécessairement une PCR ou une positivité des anticorps, ce qui suggère que certaines peuvent éliminer une infection subclinique avant la séroconversion. Les cellules T peuvent contribuer à la clairance rapide du SRAS-CoV-2 et d’autres infections à coronavirus1-3. Nous avons émis l’hypothèse que les réponses des cellules T mémoires préexistantes, avec un potentiel de protection croisée contre le SARS-CoV-24-11, se développeraient in vivo pour favoriser un contrôle viral rapide et faire avorter l’infection. Nous avons mesuré les lymphocytes T réactifs au SRAS-CoV-2, y compris ceux contre le complexe de transcription de la réplication précoce (RTC)12,13, chez des travailleurs de la santé (TS) faisant l’objet d’un suivi intensif et demeurant négatifs de manière répétée par PCR, fixation d’anticorps et neutralisation (TS séronégatifs, SN-HCW). Les SN-HCW présentaient des lymphocytes T mémoires plus puissants et plus multi-spécifiques que ceux d’une cohorte pré-pandémique non exposée, et plus fréquemment dirigés contre le RTC que les réponses dominées par les protéines structurelles observées après une infection détectable (cohorte concurrente appariée). Les SN-HCW présentant les cellules T spécifiques du RTC les plus fortes présentaient une augmentation de l’IFI27, une signature innée précoce robuste du SRAS-CoV-214, suggérant une infection abortive. L’ARN-polymérase à l’intérieur du RTC était la plus grande région de conservation de séquence élevée entre les coronavirus humains saisonniers (HCoV) et les clades du SARS-CoV-2. L’ARN-polymérase était préférentiellement ciblée (parmi les régions testées) par les cellules T des cohortes pré-pandémiques et du SN-HCW. Des cellules T spécifiques de l’épitope RTC reconnaissant les variantes du HCoV ont été identifiées dans le SN-HCW. Les cellules T préexistantes enrichies spécifiques de l’ARN-polymérase se sont développées in vivo pour s’accumuler préférentiellement dans la réponse mémoire après une infection putative abortive par rapport à une infection manifeste par le SRAS-CoV-2. Nos données mettent en évidence les cellules T spécifiques du RTC comme cibles pour les vaccins contre les Coronaviridae endémiques et émergents.

Source : https://www.nature.com/articles/s41586-021-04186-8

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